Dans un terminal se rendre dans le profil utilisateur à la racine
Compresser le dossier .thunderbird
tar -jcvf thunderbird-email-profil.tar.bz2 .thunderbird
Il ne vous restera plus qu'a le copier dans un hdd externe.
Coller l'archive dans votre profil utilsateur à restaurer
Decompresser l'archive de sauvegarde.
tar -xvf thunderbird-email-profile.tar.bz2
Attention à le restaurer sur la même version de Thunderbird, sinon vous aurez un beau message d'erreur !